Per Schrøder er uddannet linieofficer og pilot i Flyvevåbnet.
Efter ansættelser i Flyvevåbenets Officerskole og Mærsk, blev Per Schrøder i 1988 ansat i SAS, hvor han har haft flere lederjobs bl.a. som Head of Crew Management, Vice President Operations, før han i 2008 blev udnævnt til On Time General, også kaldet Punktlighedsgeneral.